Organizm człowieka zamieszkiwany jest przez ok. 100 bilionów bakterii. Największe ich siedlisko znajduje się w przewodzie pokarmowym. Szacuje się, że w przewodzie pokarmowym każdego człowieka żyje ok. 1000–1500 gatunków bakterii. Mikroflora jelitowa pełni bardzo ważne funkcje: bakterie biorą udział w metabolizmie organizmu, wytwarzaniu witamin z grupy B, wit. K i kwasu foliowego oraz w absorpcji elektrolitów i soli mineralnych, takich jak sód, wapń, magnez czy potas.